\documentclass[a4paper, oneside, 10pt]{article}
\usepackage[utf8x]{inputenc}
\usepackage[czech]{babel}
\usepackage[normalem]{ulem}
\usepackage[unicode]{hyperref}
\begin{document}

\section{\texorpdfstring{Kořenový dokument}{Korenovy dokument}}
\label{sec:korenovy_dokument}
Text kořenového dokumentu.

%RECURSIVELY INSERTED FILE START

\subsection{\texorpdfstring{Vnořený dokument}{Vnoreny dokument}}
\label{sec:vnoreny_dokument}

Text vnořeného dokumentu.

%RECURSIVELY INSERTED FILE START

\subsubsection{\texorpdfstring{Vnořený dokument 2}{Vnoreny dokument 2}}
\label{sec:vnoreny_dokument_2}

Text vnořeného dokumentu 2

\paragraph{\texorpdfstring{aařa}{aara}}
\label{sec:aara}
\subparagraph{\texorpdfstring{bbřb}{bbrb}}
\label{sec:bbrb}
~\newline
\textbf{ccřc}
\label{sec:ccrc}
~\newline
\textbf{ddřd}
\label{sec:ddrd}

\sout{deleted}

%RECURSIVELY INSERTED FILE END

%RECURSIVELY INSERTED FILE END

\href{http://localhost/_bp/doku.php?id=test:test7-vnoreny}{Odkaz}

Text kořenového dokumentu.


\end{document}